【摘 要】
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旨在探究终末宿主肝环状RNA (circRNAs)在犬弓首蛔虫诱导致病过程中的潜在调控作用.18只6～7周龄的比格犬被平均分为3组(感染后0.5d组、感染后1d组和感染后36 d组),每组包括感染和对照各3只,分别于感染后对应的时间点收集肝样品.提取感染和对照组肝的总RNA,利用高通量RNA测序,构建circRNA文库,对差异表达的circRNAs进行分析,并对差异表达circRNAs的亲本基因进行GO注释和KEGG富集分析.随机选取9个差异表达circRNAs进行实时荧光定量PCR验证.结果 显示,与对
【机 构】
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东北农业大学动物医学学院,黑龙江省动物源性人兽共患病重点实验室,哈尔滨150030;中国农业科学院兰州兽医研究所,家畜疫病病原生物学国家重点实验室,兰州730046;山西农业大学动物医学学院,太谷03
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旨在探究终末宿主肝环状RNA (circRNAs)在犬弓首蛔虫诱导致病过程中的潜在调控作用.18只6～7周龄的比格犬被平均分为3组(感染后0.5d组、感染后1d组和感染后36 d组),每组包括感染和对照各3只,分别于感染后对应的时间点收集肝样品.提取感染和对照组肝的总RNA,利用高通量RNA测序,构建circRNA文库,对差异表达的circRNAs进行分析,并对差异表达circRNAs的亲本基因进行GO注释和KEGG富集分析.随机选取9个差异表达circRNAs进行实时荧光定量PCR验证.结果 显示,与对照组相比,在感染后0.5、1和36 d分别有94、103和84个犬肝的差异表达circRNAs.Venn图显示,3个感染阶段没有共同表达的差异circRNAs;GO和KEGG分析显示,差异表达的circRNAs参与了宿主肝免疫与炎症的相关通路,其中差异表达的circRNA novel_circ_0016108、novel_circ_0016184和novel_circ_0027468与犬弓首蛔虫引起的天然免疫相关;novel_circ_0002212参与了犬弓首蛔虫引起的肝炎症反应;novel_circ_0002212和novel_circ_0019907在宿主肝抵抗犬弓首蛔虫侵袭的过程中发挥作用.RT-qPCR验证结果显示大多数差异表达的circRNAs与高通量测序结果一致.结果 表明,肝circRNAs在犬弓首蛔虫感染终末宿主的过程中发挥着重要作用,这为进一步探究犬弓首蛔虫与宿主之间的相互作用提供了新的信息,并且也为促进疾病干预措施的制定提供参考.
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为实现田间条件下水稻稻瘟病、纹枯病、白叶枯病3种常见水稻叶部病害的快速识别和诊断,提出了一种基于交换粒子群优化算法(SPSO)和支持向量机(SVM)的水稻病害诊断方法.首先在田间采集300幅水稻叶部病害图像,利用中值滤波方法和方向梯度直方图,得到3种病害3780维特征向量;然后建立病害识别支持向量机模型,使用交换粒子群优化算法(SPSO)优化支持向量机径向基函数(RBF)的参数γ和惩罚因子c.结果表明:该方法优于单独使用支持向量机或粒子群(PSO)算法优化的支持向量机模型,3种水稻叶部病害平均识别准确率达
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