【摘 要】
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利用Codon W与EMBOSS等程序，分析42种不同植物来源的PAL基因序列密码子偏好性及可能形成机制，旨在为植物PAL基因的表达提高提供理论指导。RSCU结果显示，相比其他植物单子叶植物的密码子偏好性较高，CUC是其最优密码子。单子叶等植物偏好以G/C编码，双子叶植物偏好以A/T编码。ENc-plot结果表明，双子叶植物的偏好性主要受自然选择的影响，而单子叶植物的偏好性受到突变与自然选择的双重
【基金项目】
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国家自然科学基金青年科学基金项目（31500276）； 四川省重点研发项目（2018SZ0061）； 四川省应用基础研究项目（2017JY0222）； 大学生科研训练项目（200907）；
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利用Codon W与EMBOSS等程序，分析42种不同植物来源的PAL基因序列密码子偏好性及可能形成机制，旨在为植物PAL基因的表达提高提供理论指导。RSCU结果显示，相比其他植物单子叶植物的密码子偏好性较高，CUC是其最优密码子。单子叶等植物偏好以G/C编码，双子叶植物偏好以A/T编码。ENc-plot结果表明，双子叶植物的偏好性主要受自然选择的影响，而单子叶植物的偏好性受到突变与自然选择的双重影响。聚类分析表明，基于CDS序列的聚类比基于RSCU聚类更适合作为植物系统发育分析。绝大多数单子叶植物适合在大肠杆菌中表达，而双子叶植物的PAL基因适合在酵母中表达；拟南芥相比烟草更适合作为所有42种植物PAL基因的遗传转化宿主。研究结果可为植物PAL基因的遗传进化研究与功能验证等奠定理论基础。
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