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2016年9月—2017年2月,全球分离到2009年大流行甲型H1N1(甲型H1N1pdm09)、甲型H3N2和乙型流感病毒。对流感病毒分离株的抗原性和遗传学分析表明,几乎所有新近分离的甲型H1N1pdm09流感病毒的抗原性都与疫苗病毒A/California/7/2009和A/Michigan/45/2015难以区分,大多数新近流行的病毒属于进化亚枝6B.1。大多数新近分离的甲型H3N2流感病毒的抗原性与细胞培养病毒A/Hong Kong/4801/2014相关,且大多属于进化亚枝3C.2a1。新近分离的B/Victoria/2/87谱系病毒的抗原性和遗传性与B/Brisbane/60/2008和B/Texas/2/2013密切相关,B/Yamagata/16/88谱系病毒与B/Phuket/3073/2013密切相关。