【摘 要】
：
扩展蛋白作为一种细胞壁松弛蛋白,参与了植物的生长发育和抗性过程,在植物基因组中具有不可或缺的作用.本研究依据已经测序的红皮柳基因组数据,鉴定了34个扩展蛋白基因,隶属
【机 构】
：
北京林业大学,林木育种国家工程实验室,北京,100083
论文部分内容阅读
扩展蛋白作为一种细胞壁松弛蛋白,参与了植物的生长发育和抗性过程,在植物基因组中具有不可或缺的作用.本研究依据已经测序的红皮柳基因组数据,鉴定了34个扩展蛋白基因,隶属于4个不同的亚家族,分布在14条染色体上.蛋白理化特征分析发现,多数扩展蛋白表现偏碱性,脂溶指数较高,蛋白结构稳定性较好.亚家族内的成员序列保守性更强,氨基酸一致率介于34.2％～99.4％之间,而不同亚家族间成员的氨基酸一致率介于15.0％～39.8％之间.亚家族内的基因外显子-内含子结构模式相似,亚家族间的基因结构组成存在明显差异.密码子使用分析发现,红皮柳扩展蛋白基因具有5个高频密码子,自然选择对密码子使用偏性影响较大.共线性分析显示,红皮柳扩展蛋白基因的分化与柳树进化过程中的基因组倍性事件有关.研究结果有助于理解扩展蛋白基因在柳树生长发育及进化中的地位,也为深入研究柳树扩展蛋白基因功能提供了参考.
其他文献
IspH基因作为MEP途径中的关键酶具有促进下游萜类化合物产量的积累和提高植物对外界的抵御能力的特定作用,本研究旨在通过对烟草中IspH基因进行克隆与原核表达分析,从野生型
作为植物抗氧化防御系统的主要保护酶之一,过氧化氢酶在植物细胞响应逆境胁迫应答方面发挥重要作用.本研究通过生物信息学分析RNA-Seq数据(NCBI登录号:PRJNA285946),结合RT-P
基于基因组序列信息,研究了二倍体森林草莓和八倍体栽培草莓染色体上SSR位点的分布特点.利用AutoSSR软件在森林草莓和栽培草莓中分别发掘到153 826个和329 801个SSR位点,发生
为了获得姜荷花叶绿素降解的关键酶基因PPH信息,本试验在前期通过姜荷花全长转录组测序获得大量转录组信息的基础上,进行筛选分析,获得了2条PPH基因,分别命名为PPH1和PPH2.PP
2-C-甲基-D-赤藓糖醇-2,4-环焦磷酸合成酶(MDS)是MEP代谢途径中的关键酶.为了鉴定芒果中的MDS家族基因,探索MDS家族基因的进化、表达模式.本研究采用同源搜索的方法,从13个植
目的 探究螺旋CT检查对急性胸腹部创伤的诊断意义.方法 从2018年5月到2020年5月我院收治的急性胸腹部创伤患者中随机选择100例作为研究对象,均分成两个小组,对照组和实验组,
糖基转移酶(glycosyltransferases,GT;EC 2.4.x.y)是植物体内催化糖基化的主要酶,在催化次生代谢物合成、调节激素平衡以及参与植物非生物胁迫等方面发挥着重要的作用.为了更
天目铁木为中国特有的珍稀濒危植物,5株原生株分布在浙江西天目山.随着环境条件的不断恶化,对濒危植物的保护变得尤为重要,从20世纪80年代初开始对天目铁木开展研究,然而到目
目的 探讨护理干预对慢性乙肝患者治疗依从性和生活质量的影响价值.方法 采用医学研究观察对比法,选定陕西西安某医院2018年2月-2021年2月以来收治的100例慢性乙肝患者,按照
目的 探讨分析血液灌流、血液透析在急诊重症有机磷农药中毒治疗中的效果.方法 2019.12-2020.12,抽取医院急诊科收治的90例重症有机磷农药中毒患者展开研究,依循随机双盲法分