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南盘江坳陷二叠系划分为12个三级层序，平均每个层序延续时限为3Ma。进而将三级层序划分为4个Ⅰ型层序和8个Ⅱ型层序。三级层序虽然在不同地区发育完整性有所不同，但总体可以进行对比。三级层序构成两个超层序。超层序SS1沉积期，南盘江坳陷主要为台、盆相间古地理格局，具有狭窄的台地边缘一台地斜坡沉积。钦防地区为半深海环境。超层序SS2沉积末期，右江地区从台、盆相间格局演化到盆包台格局。上扬子古陆主体为开阔台地一局限台地，而靠近川滇古陆则变为陆相环境。