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1996年台湾教育主管部门在五所公立高校首先试行校务基金,到1999年台湾已全面实施校务基金制度.校务基金是台湾教育主管部门为公立大学院校财务有效运作,提高营运绩效,以适应高等教育发展趋势,提升教育品质,按照《国立大学校院校务基金设置条例》及《预算法》规定,遵循预算程序设置,编制附属单位预算的特种基金.