【摘 要】
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为了解目前国内猪流行性腹泻病毒流行毒株与疫苗毒株的S蛋白差异情况,从2013年采自北京、河南、陕西、广东四个省市的疑似猪流行性腹泻病料中抽提RNA,用设计的针对结构基因S
【基金项目】
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科技部科技基础性工作专项——重大动物疫病病原及相关制品标准物质的研究(2008FY130100)
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为了解目前国内猪流行性腹泻病毒流行毒株与疫苗毒株的S蛋白差异情况,从2013年采自北京、河南、陕西、广东四个省市的疑似猪流行性腹泻病料中抽提RNA,用设计的针对结构基因S的特异性引物进行RT-PCR扩增、克隆及测序,并对其序列变化、遗传进化情况和抗原位点进行分析。结果显示:4个样品株的S基因（4161 bp）与国内疫苗株CV777（4152 bp）相比,存在15个核苷酸的插入和6个核苷酸的缺失,导致推导的氨基酸序列存在5个氨基酸的插入(59QGVN62and140N)和2个氨基酸的缺失(163NI164),且在主要突变区S1区的2个中和表位（499638aa和764771aa）有7处氨基酸突变。遗传进化分析结果显示,4个样品株与主要疫苗株同源性较低（93.8%94.7%）,而与20072009年韩国毒株、2011年日本毒株以及中国近年流行毒株同源性高（96.0%99.6%）,表明近年来国内猪流行性腹泻病毒呈现较大变异,可能需要研制更有效的疫苗用于猪流行性腹泻的防控。
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