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染色体和质粒分别介导污泥中的抗生素抗性基因（Antibiotic resistance genes， ARGs）进行垂直和水平转移，使ARGs在亲代或不同菌种之间传播，导致污泥蚯蚓堆肥对ARGs的削减有限.本实验通过研究蚯蚓堆肥过程中染色体与质粒上ARGs和移动遗传元件（Mobile genetic elements， MGEs）的丰度变化，以无添加蚯蚓为对照，进行20 d的蚯蚓堆肥，探究蚯蚓堆肥对污泥中ARGs的垂直和水平转移的影响.结果显示：前10 d是污泥蚯蚓堆肥中ARGs转移的高峰期.除了tetM，蚯蚓组其余ARGs丰度在质粒和染色体上均发生了显著的增加（P＜0.05）.与对照组相比，质粒上的ermF、ermB、tetX、sul1的丰度在蚯蚓组显著增加了1.02倍、1.97倍、2.43倍、0.75倍（P＜0.05），而染色体上仅ermB在蚯蚓组显著增加（P＜0.05）.对于MGEs，质粒上的intⅠ1丰度在蚯蚓组中比对照组显著增加了1.63倍（P＜0.05），而染色体上的却截然相反，是对照组大于蚯蚓组.堆肥的后10 d，两组染色体和质粒中的MGEs和总ARGs的丰度均降低，且蚯蚓堆肥组降低速度更快.蚯蚓堆肥中，在质粒上MGEs与ermF、ermB、sul2有显著的正相关性（P＜0.05），而在染色体上MGEs与所有ARGs均无显著相关性.冗余分析发现，ARGs的变化与MGEs、蚯蚓堆肥引起的环境变化有关，而且环境因素如电导率、有机质、氨氮和硝氮，对质粒上ARGs和MGEs的影响比对染色体的更为强烈.综上所述，携带MGEs的质粒介导的水平转移是蚯蚓堆肥中ARGs难以削减的主要原因.