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大肠癌早期发生中常伴随基因突变、蛋白质和酶等分子代谢异常，通过检测粪便中基因、蛋白质和酶等标志物有助于大肠癌早期诊断。其中粪便K—ras、APC、p53、长片段DNA、DNA甲基化、钙卫蛋白（CPT）、微型染色体维持蛋白一2、促衰变因子、癌胚抗原（CEA）、Adnab-9和端粒酶、环氧合酶2（COX-2）、肿瘤M2型丙酮酸激酶（TUM2-PK）等在筛选大肠癌中取得了较大进展。