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学术权力与行政权力的关系的研究观点概括为四种：冲突论、协调统一论、对立统一论和不对称论。学者们主要从理念、制度、机制三个方面设计了协调行政权力与学术权力关系的基本思路。多数学者认为，通过强化学术权力，建立起学术权力与行政权力相互协调的运行机制是协调两者关系的最直接有效的办法。从多元权力结构视角研究两者之间的关系是研究的趋势，也符合我国高校内部现存的权力结构。