应用聚类分析和GO数据库分析间变性星形细胞瘤的微阵列数据

来源 :中国实验诊断学 | 被引量 : 0次 | 上传用户：jklbnm123jkl

【摘要】

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目的探讨从巨量的微阵列基因数据中挖掘肿瘤相关分子机理及功能信息;方法以人肿瘤cDNA微阵列1.2分析并获得间变性星形细胞瘤和正常脑组织的差异表达基因数据,进行基于CityBlo

【作者】

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江荣才喻辉浦佩玉屠康郭政李霞焦宝华

【机构】

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天津医科大学总医院,哈尔滨医科大学生物信息学中心和哈尔滨基太生物芯片有限责任公司,河北医科大学第二附属医院,天津医科大学总医院

【出处】

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中国实验诊断学

【发表日期】

：

2004年1期

【关键词】

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GO数据库星形细胞瘤微阵列数据 eDNA微阵列聚类分析生物信息学 cluster analysis Gene OntologyTM Consortium

【基金项目】

：

国家自然科学基金

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目的探讨从巨量的微阵列基因数据中挖掘肿瘤相关分子机理及功能信息;方法以人肿瘤cDNA微阵列1.2分析并获得间变性星形细胞瘤和正常脑组织的差异表达基因数据,进行基于CityBlock距离和平均距离法的聚类分析,应用超几何分布的概率模型计算聚类分析所得的各基因类与GO数据库注释的各基因功能类之间的随机关联概率,给各基因类标以显著关联的GO数据库的功能类标签.结果从数以千计的基因数据中获得了121个差异显示基因并分成6类,这6类基因的生物学功能基本与该肿瘤的生物学特点符合.GO数据库中6个基因通路功能类分别与该

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