【摘 要】
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对5 472条蝴蝶兰无冗余EST序列进行了SSR搜索,共检索出376条EST含有419个SSR位点,平均每7.4 kb EST序列出现1个SSR。共有60种SSR的重复基元,其中二核苷酸和三核苷酸重复基元
【机 构】
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广东省农科院花卉研究所/广东省园林花卉种质创新综合利用重点实验室,广东省农科院作物研究所
【基金项目】
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广东省农业攻关项目(2009B020305009), 广东省农业科学院支撑计划项目(07-支撑-39)
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对5 472条蝴蝶兰无冗余EST序列进行了SSR搜索,共检索出376条EST含有419个SSR位点,平均每7.4 kb EST序列出现1个SSR。共有60种SSR的重复基元,其中二核苷酸和三核苷酸重复基元占主导地位,分别占SSR总数的67.1%和30.3%;AG/CT在SSR基元中出现频率最高(46.1%),AT/AT次之(18.6%)。根据搜索结果设计了100对蝴蝶兰EST-SSR引物,并随机合成了20对引物。以2个蝴蝶兰品种的DNA为模板,对引物进行了筛选和评价,有16对引物扩增出稳定且清晰的目标产物
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