【摘 要】
:
【目的】筛选并分析石榴生长素响应因子(auxin response factor,ARF)基因家族,为解析石榴ARF基因功能及信号转导调控机制的研究提供参考。【方法】利用生物信息学工具,系统地
【机 构】
:
南京林业大学南方现代林业协同创新中心,南京林业大学林学院
【基金项目】
:
南京林业大学高层次人才科研启动基金(GXL2014070);南京林业大学优秀博士学位论文创新基金;江苏省普通高校研究生科研创新计划(KYLX16_0857);江苏省高校优势学科建设工程项目(PAPD)
论文部分内容阅读
【目的】筛选并分析石榴生长素响应因子(auxin response factor,ARF)基因家族,为解析石榴ARF基因功能及信号转导调控机制的研究提供参考。【方法】利用生物信息学工具,系统地分析石榴ARF基因家族成员的基因结构、蛋白理化性质、蛋白结构、保守基序、系统进化和RNA-Seq数据。【结果】石榴全基因组中鉴定出19个可能的ARF家族基因,根据系统发育树可以划分为4类。PgARF基因家族成员的扩张与全基因组复制事件有关,存在串联重复现象。RNA-Seq数据分析表明,PgARF有一定的组织表达特异性,存在假基因化和新功能化的可能。【结论】整合以上基因结构、系统发育与进化、RNA-Seq表达等分析结果,发现石榴ARF蛋白具有典型的B3、Auxin_resp结构域,多数还具有Aux/IAA结构域。石榴ARF基因家族基因结构和保守基序的进化与进化时间相关,同时家族成员扩张主要与全基因组复制事件相关。
其他文献
阐述了应收账款管理的目标、应收账款管理不善的弊端及管理应收账款的措施。
为延迟边界层分离以改善超声速进气道/隔离段性能,运用数值模拟方法研究来流马赫数2.0条件下微型涡流发生器与微射流涡流发生器组合的流动控制特性,着重比较了射流位置对流场
足球运动是世界人民最热爱的体育运动项目之一,其具有极高的竞技性和观赏性,吸引了无数足球爱好者的青睐。我国民众也是如此,每当奥运会、世界杯等世界高水平足球赛事开赛之
云南、贵州地处中国西南,幅员辽阔,其地域蕴含着大量原生态染织技术与文化。从2006年中国公布的第一批非物质文化遗产名录开始,至2017年7月已颁布四批。本文以国家颁布的四批
隐涵是日常会话中常见的语言现象。格赖斯在《逻辑与会话》一文中提出了话语的隐涵理论。周礼全先生进一步发展了这一理论。周先生对格赖斯隐涵理论的发展主要
利用三氧化硫在低温条件下与聚苯乙烯合成聚苯乙烯磺酸,反应速度快,副反应少,后处理简单,是一种绿色合成新工艺。实验结果发现,最佳的反应条件为:常压下-20℃时,以氯仿为溶剂
现在的生活节奏越来越快,身边的每个人都是行色匆匆,自己也常常是跑着步去赶地铁,跑步去吃饭,目的是为了使生活节奏紧凑,有更多的时间去做更多的事情。但是,有时候会发现忙忙碌碌一
为加强社会主义法制建设,介绍了推进依法治企的一些相关法律、管理制度。