土壤盐碱胁迫是作物生产的重要障碍，钠离子则是引起水稻盐碱危害的主要因素。了解水稻耐盐碱生理机制和遗传改良的途径，对于耐盐碱品种的选育和减轻盐碱危害的生理研究有重要意义。水稻根系既是向植株地上部输送水分和养分的场所，又是最先感知土壤盐碱度的器官，根系对盐碱信号的感应在研究水稻对盐碱胁迫的响应中起到重要作用，是研究水稻耐盐碱生理的一个关键方向。本文从根系对无机离子吸收与调控、渗透物质平衡及转运蛋白调节、激素调节等方面概述了水稻耐盐碱胁迫的生理机制，从数量性状位点分子标记、耐盐碱水稻种质资源的利用和品种培育等方面介绍了盐碱胁迫遗传改良的研究进展。同时，本文基于多年来国内外研究，对水稻耐盐碱的生理机制和水稻耐盐碱基因定位及分子标记改良目前存在的问题进行了总结，讨论了减轻水稻盐碱胁迫的综合调控技术并提出了今后研究的重点内容。