基于隐马尔可夫模型对原核生物编码序列的识别

来源 :中国卫生统计 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xieyinglan2007
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目的探讨隐马尔可夫模型在大肠杆菌编码序列识别中的应用,为生物信息挖掘、致病位点研究提供方法参考。方法对大肠杆菌训练集数据进行训练建模,并对测试序列进行识别,用特异度、灵敏度以及精确度三个指标进行评价。结果利用本试验的方法识别编码序列的灵敏度为73.33%,特异度为67.78%,精确度为70.56%。结论隐马尔可夫模型能很好地模拟离散状态间的转换,适用于识别有状态转移、线性序列的数据。
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