目的探讨荧光定量PCR技术检测肉芽肿病变中结核/非结核性分枝杆菌的可靠性和敏感性。方法采用特殊染色(抗酸、金胺O染色)及荧光定量PCR技术对200例肉芽肿病变中的分枝杆菌进行检测。结果 200例肉芽肿病变中62例抗酸染色(31%)阳性,81例金胺O染色(40.5%)阳性,103例荧光定量PCR检测(51.50%)分枝杆菌阳性,其中100例(50.00%)检出结核杆菌,3例(1.5%)检出非结核分枝杆菌,3种方法检测出的阳性率差异有统计学意义(P<0.05)。典型结核组的抗酸染色阳性率(51.5%)和金胺O染色阳性率(65.7%)及荧光定量PCR检测结核杆菌阳性率(75.8%)皆高于非典型结核组(10.9%、15.8%及24.8%),差异均具有统计学意义(P<0.05)。97例荧光定量PCR检测阴性的标本中15例(15.5%)呈抗酸染色和(或)金胺O染色阳性,82例标本(84.5%)荧光定量PCR检测、金胺O染色和抗酸染色检测均阴性。82例特殊染色和荧光定量PCR检测结核分枝杆菌均阴性标本进行荧光定量PCR重复检测,结核分枝杆菌阳性率典型结核组为35.5%,疑似结核组为3.9%;200例标本荧光定量PCR重复检测后总阳性率从51.5%增至56.5%。结论采用荧光定量PCR检测病变组织中的分枝杆菌,对结核/非结核分枝杆菌分类有效,阳性率高于特殊染色(抗酸、金胺O染色),为临床诊治提供可靠依据。