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猪流行性腹泻病毒(PEDV)辽宁株序列测定及分析

来源 :中国兽医杂志 | 被引量 : 3次 | 上传用户：Dec-87

【摘要】

：

为弄清2014年沈阳某猪场腹泻原因,应用RT-PCR方法对采自该场样品进行猪流行性腹泻病毒(PEDV)S1基因扩增,并将产物纯化后测序、分析。结果得到长为2 376 bp的S1基因序列;本病毒与2013年美国暴发毒株以及我国2010年毒株核苷酸和氨基酸同源性较高,而与疫苗株同源性较低;同时存在氨基酸的插入、缺失及糖基化位点的改变;在进化树上,与2010-2011年在我国暴发的猪流行性腹泻病毒为与同

【作者】

：

李井春王姗姗姚伟谭立文杨本勇魏澍张雅为赵凤菊顾贵波

【机构】

：

辽宁省动物疫病预防控制中心,辽宁沈阳,110164辽宁省畜牧兽医局,辽宁沈阳,110001;大连市动物疫病预防控制中心,辽宁大连,116037;

【出处】

：

中国兽医杂志

【发表日期】

：

2016年03期

【关键词】

：

PEDV 辽宁株序列分析 S1基因

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为弄清2014年沈阳某猪场腹泻原因,应用RT-PCR方法对采自该场样品进行猪流行性腹泻病毒(PEDV)S1基因扩增,并将产物纯化后测序、分析。结果得到长为2 376 bp的S1基因序列;本病毒与2013年美国暴发毒株以及我国2010年毒株核苷酸和氨基酸同源性较高,而与疫苗株同源性较低;同时存在氨基酸的插入、缺失及糖基化位点的改变;在进化树上,与2010-2011年在我国暴发的猪流行性腹泻病毒为与同一亚群,与2013年美国毒株也有较近的亲缘关系。表明分离到猪流行性腹泻病毒,此病毒已发生部分变异,需给予

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