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目的运用弱阳离子磁珠(magnetic beads based weak cation exchange,MB-WCX)联合基质辅助激光解吸离子飞行时间质谱(matrix assisted laser desorption ionization time of flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)建立结直肠癌血清蛋白组学诊断模型。方法收集我院正常对照(健康体检者)、结直肠癌术前及术后患者血清标本各72例,弱阳离子磁珠分离血清多肽,MALDI-TOF MS建立正常对照、结直肠癌术前及术后患者血清蛋白表达谱,Clin Prot Tools 2.0软件分析差异表达峰并建立诊断模型,液相色谱-电喷雾离子化质谱(liquid chromatography-eletronic spray ionization mass/mass,LC-ESIMS/MS)鉴定差异表达蛋白。结果对比分析正常对照、结直肠癌术前及术后血清蛋白图谱,共发现80个差异表达峰,12个峰差异具有统计学意义(均P<0.01),与对照组相比,其中9个差异峰在结直肠癌术前的血清蛋白图谱中显示升高,术后显示降低,3个峰在结肠癌术前的血清蛋白图谱中显示降低,术后显示升高。遗传算法(genetic algorithm,GA)模型诊断结直肠癌的敏感度和特异性分别为99.31%和96.49%。GA模型中m/z:2663.36、m/z:4793.17和m/z:5343.48的差异表达峰经鉴定分别为纤维蛋白原α前体亚型1(isoform 1 of Fibrinogen alpha chain precursor,FGA)、组蛋白赖氨酸甲基转移酶SETD7(histone-lysine N-methyltransferase SETD7,SETD7)和黏蛋白5AC(Mucin-5AC precursor,MUC5AC)。结论血清蛋白质谱模型能够准确区分正常对照与结直肠癌患者,但尚需更进一步研究证实。