湾区是引领全球经济增长和科技创新的重要增长极,湾区创新生态系统的发展呈现出"萌芽期—成长期—成熟期"的演进历程。基于创新生态系统演化的视角,从创新主体、创新资源、创新环境和创新能力等系统主要构成要素对粤港澳湾区与旧金山湾区演化进程进行比较分析,结果表明:旧金山湾区处于创新生态系统的成熟期,拥有以创新企业为主体、产学研紧密协作为核心的创新生态网络,高端科技人才与风险资本汇聚,科技立法体系完备,创新氛围浓厚。而粤港澳大湾区尽管创新主体基数庞大,但优质研究型学府匮乏,缺乏高层次人才族群,基础研究资金投入不足,原始创新举步维艰,完备的科技政策体系与多元文化尚未形成,粤港澳大湾区仍处于创新生态系统的成长初期,还有巨大的发展空间。借鉴旧金山湾区的成功经验,粤港澳大湾区的创新发展应重视创新产出评价机制,关注创新质量提升;深化产学研协同合作,以知识溢出带动创新集群升级;优化创新人才培养,注重科技与金融深度融合;推动湾区协同发展,促进要素跨界流动。