【摘 要】
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目的 针对临床数据变量类型多、数据结构复杂的特征,基于R-shiny开发交互式分析临床数据并展示结果的应用.方法 基于R-shiny与R语言,搭建应用的UI(用户界面)和Server(后台功能),将相应代码封装并部署在网页上.以UK Biobank乳腺癌数据为例,对其临床及基因数据进行分析,查看R-shiny应用的分析效果.结果 构建出能够交互式分析临床数据的R-shiny应用,可供用户上传临床数据、生存型数据及基因数据进行分析.将UK Biobank数据作为示例进行分析,得到了具有临床与生物学意义的结果
【机 构】
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上海交通大学生命科学学院生物信息与生物统计系 200240;上海交通大学转化医学研究院;上海交通大学生命科学学院生物信息与生物统计系 200240;上海交通大学转化医学研究院
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目的 针对临床数据变量类型多、数据结构复杂的特征,基于R-shiny开发交互式分析临床数据并展示结果的应用.方法 基于R-shiny与R语言,搭建应用的UI(用户界面)和Server(后台功能),将相应代码封装并部署在网页上.以UK Biobank乳腺癌数据为例,对其临床及基因数据进行分析,查看R-shiny应用的分析效果.结果 构建出能够交互式分析临床数据的R-shiny应用,可供用户上传临床数据、生存型数据及基因数据进行分析.将UK Biobank数据作为示例进行分析,得到了具有临床与生物学意义的结果.结论 将R-shiny与临床数据分析结合,为使用者提供了分析临床数据的简便方式,并为UK Biobank数据提供新的交互式展示分析平台.
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