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对皖江示范区区域创新投入和产出纵向比较和横向比较可知，皖江示范区区域创新无论是投入还是产出，其规模不断扩大，但示范区内部各城市投入与产出呈现不平衡现象。利用数据包络分析法评价2012年皖江各城市的创新投入与产出效率，结果显示，皖江示范区创新综合效率较高，但只有马鞍山市和六安市同时达到技术有效和规模有效，皖江示范区R＆D活动人员投入有冗余。针对问题给出了一些建议。