鱼类是湿地生物多样性的重要组成部分。作为水鸟的食物，鱼类的多样性直接影响着湿地中鸟类群落结构的稳定性。2013年，吉林莫莫格国家级自然保护区被列入中国国际重要湿地名录，该保护区中的湿地是白鹤（Grus leucogeranus）和东方白鹳（Ciconia boyciana）等迁徙鸟类的重要停歇地。2017～2022年，采用内陆鱼类多样性调查与评估技术，对该保护区中河流和湖泊的鱼类物种多样性组成和鱼类群落结构进行了研究，利用2007～2011年和2017～2022年该保护区河流和湖泊的鱼类采样和调查数据以及文献资料，分析了鱼类物种多样性组成特点，探讨了鱼类物种的地理分布特征和鱼类群落结构动态，分析了其与鸟类的关系。研究结果表明，2007～2022年，在吉林莫莫格国家级自然保护区中的嫩江的5处江段和5座湖泊（鹅头泡、茨勒泡、哈尔挠泡、莫什海泡和月亮泡）中，共记录5目11科47属57种鱼类，2017～2022年的鱼类物种丰富度和Margalef丰富度指数的平均值比2007～2011年的分别减小了8.89%和16.53%；鱼类的种上分类阶元物种分布格局为鲤形目和鲤科占主体，具有东亚内陆鱼类组成的共同特点；鱼类物种的绝对特有性为5种，相对特有性为9.43%，鱼类相对特有性高于黑龙江水系的典型地理区；鱼类物种的绝对濒危性为5种，相对濒危性为9.43%，鱼类物种的相对濒危性低于黑龙江水系，但高于黑龙江水系的部分典型地理区；冷水性类群的物种数为10种，相对冷水种数为18.87%，都明显低于黑龙江水系及其典型地理区；土著鱼类由5个区系生态类群构成，北方类群物种数所占比例为28.30%，符合黑龙江水系内陆鱼类区系组成特点；2017～2022年的鱼类群落的Shannon-Wiener多样性指数、Simpson优势度指数和Pielou均匀度指数值比2007～2011年的分别增大了3.88%、1.88%和31.70%，鱼类群落的物种组成多样性和种群结构的稳定性水平在提高。