【摘 要】
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借助中药系统药理数据库和分析平台(TCMSP)、BATMAN-TCM数据库(Bioinformatics Analysis Tool for Molecular Mechanismof Traditional Chinese Medicine)对少腹逐瘀汤的有效成分及靶点进行检索,于比较毒物基因组学数据库(Comparative Toxicogenomics Database,CTD)、治疗靶点数据库(Therapeutic Target Database,TTD)、人类基因数据库(The Human G
【机 构】
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甘肃中医药大学,甘肃兰州730000
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借助中药系统药理数据库和分析平台(TCMSP)、BATMAN-TCM数据库(Bioinformatics Analysis Tool for Molecular Mechanismof Traditional Chinese Medicine)对少腹逐瘀汤的有效成分及靶点进行检索,于比较毒物基因组学数据库(Comparative Toxicogenomics Database,CTD)、治疗靶点数据库(Therapeutic Target Database,TTD)、人类基因数据库(The Human Gene Database,GeneCards)、疾病相关的基因与突变位点数据库(DisGeNET)中,分别以“endometriosis”“dysmenorrhea”为关键词,获取子宫内膜异位症和痛经的相关靶点.通过Cytoscape 3.8.0构建“中药-有效成分-治疗靶点”网络.借助STRING 11.0数据库构建蛋白互作网络,同时借助Cytoscape 3.8.0软件中Analyze Network插件计算网络中节点的拓扑参数,筛选出网络中起重要作用的蛋白质.将潜在治疗靶点导人RStudio软件,利用clusterProfiler包对潜在治疗靶点进行基因本体论(Gene Ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析.最后,借助AutoDock Vina(Vina)平台进行分子对接,预测少腹逐瘀汤主要有效成分与关键靶点的结合度.通过筛选得到少腹逐瘀汤有效成分136个,靶点380个;子宫内膜异位症相关靶点1627个,痛经相关靶点142个,两者共同作用靶点107个,少腹逐瘀汤治疗子宫内膜异位症痛经的潜在治疗靶点共42个,其中白细胞介素6(IL6)、前列腺素内过氧化物合酶2(PTGS2)等靶点在少腹逐瘀汤干预子宫内膜异位症痛经的生物网络中起到重要作用,主要涉及炎性相关、激素相关信号通路以及丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)、磷脂酰肌醇-3激酶(PI3K)-蛋白激酶B(AKT)等可促进细胞增殖的信号转导通路.分子对接结果显示少腹逐瘀汤活性化合物与IL6、PTGS2等关键靶点具有较高结合能力.表明少腹逐瘀汤可通过多靶点、多途径对子宫内膜异位症痛经产生治疗作用,为其治疗子宫内膜异位症痛经的作用机制提供新思路.
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