【摘 要】
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重复序列是动物基因组的重要组分,对于基因组结构多样性、调节基因表达和介导多种遗传疾病具有重要影响。本研究采用了2种策略：基于序列比对的Repeat Masker（RM）和从头预测的Rep
【机 构】
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动物资源与生态环境教育部重点实验室,成都动物园
【基金项目】
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成都大熊猫繁育研究基金会项目(CPF2014-13)
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重复序列是动物基因组的重要组分,对于基因组结构多样性、调节基因表达和介导多种遗传疾病具有重要影响。本研究采用了2种策略：基于序列比对的Repeat Masker（RM）和从头预测的Repeat Scout（RS）,对大熊猫Ailuropoda melanoleura基因组中的重复序列进行鉴定与注释,详细阐明了其转座子元件（TE）的组成、类型、数量、亚家族、长度分布、分化率等。比较2种注释方法的结果,RM注释到的TE数量在绝大部分亚家族中均多于RS,而在某些亚家族中则少于RS;RS注释到的TE亚家族类型及平
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