【摘 要】
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大粒香作为贵州重要的优质稻资源，推广种植面积大，且在乡村振兴过程中为社会带来了较高的经济效益，但目前对大粒香基因组学理论研究报道不多。为了揭示大粒香水稻叶绿体基因组特征及系统发育关系，该文对大粒香叶绿体进行测序，分析其基因组特征。结果表明：（1）大粒香水稻cpDNA全长134 563 bp，包括一个LSC（80 864 bp），一个SSC（12 347 bp）和两个IRs（20 676 bp）。（
【基金项目】
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黔农科院青年基金（[2018]101号）;黔农科院引导项目[2018]03号； 贵州省科技基础项目（黔科合基础[2020]1Y101）； 黔科合支撑项目（[2019]2304号）； 黔科中引地项目（[2019]4001）； 黔科合平台人才项目（[2
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大粒香作为贵州重要的优质稻资源，推广种植面积大，且在乡村振兴过程中为社会带来了较高的经济效益，但目前对大粒香基因组学理论研究报道不多。为了揭示大粒香水稻叶绿体基因组特征及系统发育关系，该文对大粒香叶绿体进行测序，分析其基因组特征。结果表明：（1）大粒香水稻cpDNA全长134 563 bp，包括一个LSC（80 864 bp），一个SSC（12 347 bp）和两个IRs（20 676 bp）。（2）注释到129个基因，可分为蛋白编码、t RNA和r RNA三类基因，数量分别为85个、36个和8个。（3）密码子偏好分析显示，大粒香cpDNA密码子偏好A碱基或者U（T）碱基，亮氨酸密码子使用了1 944次，最多；半胱氨酸的密码子仅使用198次，最少。（4）检测到129个SSR，其中有95个单核苷酸重复，且大部分SSR序列由A/T碱基组成。（5）系统发育分析结果表明，大粒香与热带粳稻亲缘关系最近聚为一类。该研究揭示了大粒香叶绿体基因组信息，并确定了大粒香系统发育所属分支。
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