猪水疱病病毒外壳蛋白的二级结构和抗原表位预测

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以SVDV外壳蛋白基因序列为基础,采用Chou—Fasman法、Gamier—Robson法和Karplus—Schulz法预测蛋白质的二级结构。按Kyte—Doolittle方案、Emini方案和Jameson—Wolf方案预测SVDV外壳蛋白的B细胞表位。预测结果表明,SVDV外壳蛋白的二级结构较为复杂,含有较多的转角和无规则卷曲等柔性区域以及α-螺旋和β-折叠区段;SVDV外壳蛋白的VP1、VP2和VP3上均有多个区域为B细胞优势表位,其中VP1蛋白的B细胞表位优势区域比VP2和VP3蛋白的多,与已
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