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核核糖体DNA内转录间隔区（nrDNAITS）被广泛应用于植物系统发育研究中。近年来，发现在很多植物类群中存在ITS假基因（pseudogenes），然而这些假基因在系统发育分析中的潜在价值往往被低估，甚至在部分研究中被忽略。主要介绍假基因的生成、特性以及ITS假基因在植物系统学中的应用，并对ITS假基因的研究前景进行展望。