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基于SMP机群并行编程环境下,提出了一种MPI+Pthread的程序并行化模式.使用这种并行模式实现了对生物DNA序列拼接程序Phrap的并行化.具体分析了Phrap程序的实现流程,对每一流程针对性的提出并行化方案.并且在曙光3000高性能计算机上得到了实现,获得了较好的性能.
一种SMP机群下程序并行化模式的设计与应用
【摘 要】
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基于SMP机群并行编程环境下,提出了一种MPI+Pthread的程序并行化模式.使用这种并行模式实现了对生物DNA序列拼接程序Phrap的并行化.具体分析了Phrap程序的实现流程,对每一流
【机 构】
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中国科学院计算技术研究所软件研究室,中国科学院研究生院
【出 处】
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微电子学与计算机
【发表日期】
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2005年11期
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