【摘 要】
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DDTs (dichlorodiphenyltrichloroethane,1,1,1-三氯-2,2-双氯苯基乙烷)是一种典型的持久性有机污染物,曾在疟疾防治和农业除虫方面被广泛应用.虽然包括我国在内的很多国家已经禁止使用DDTs,但目前对环境中DDTs的检测发现它仍然广泛存在且具有新的输入源.DDTs的持续存在对近海生态系统和人类健康具有一定危害,因此它所造成的环境污染问题仍然值得关注.由于Rieske型芳香羟化双加氧酶能够起始多种持久性污染物的降解,过去的几十年里一直是芳香化合物降解领域的焦点.[目的
【机 构】
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中国科学院烟台海岸带研究所,海岸带生物学与生物资源利用重点实验室,山东烟台 264003;青岛海洋科学与技术试点国家实验室,海洋生物学与生物技术功能实验室,山东青岛266237;中国科学院大学,北京1
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DDTs (dichlorodiphenyltrichloroethane,1,1,1-三氯-2,2-双氯苯基乙烷)是一种典型的持久性有机污染物,曾在疟疾防治和农业除虫方面被广泛应用.虽然包括我国在内的很多国家已经禁止使用DDTs,但目前对环境中DDTs的检测发现它仍然广泛存在且具有新的输入源.DDTs的持续存在对近海生态系统和人类健康具有一定危害,因此它所造成的环境污染问题仍然值得关注.由于Rieske型芳香羟化双加氧酶能够起始多种持久性污染物的降解,过去的几十年里一直是芳香化合物降解领域的焦点.[目的]为探讨联苯双加氧酶对DDTs的降解特性及机制,本研究选取了食异生素伯克霍尔德氏菌LB400(Burkholderia xenovorans)联苯双加氧酶及突变体对p,p\'-DDT和o,p\'-DDT的降解过程进行研究.[方法]以BphAELB400为亲本,通过两步定点突变将283位的丝氨酸突变为蛋氨酸,获得突变体BphAES283M.通过比较亲本酶与突变体对DDTs的催化性能,模拟突变蛋白结构和分子对接等方法,探究其降解特性及机制.[结果]BphAELB400和突变体BphAES283M都无法降解对位的p,p\'-DDT,但突变体BphAES283M可以代谢o,p\'-DDT并产生2个立体异构体.对接p,p\'-DDT的BphAELB400和BphAES283M的结构分析表明,BphAELB400和BphAES283M中p,p\'-DDT的反应环均不与原晶体结构中的联苯反应环重合.而对接o,p\'-DDT的BphAES283M的结构分析表明o,p\'-DDT的反应环与晶体结构中的联苯反应环距离很近,且2、3位的碳原子与单核铁原子催化中心的距离在0.5 nm以内,此外,BphAES283M的催化腔表面积和体积比BphAELB400更大,这很可能有助于BphAES283M与o,p\'-DDT的结合.[结论]283位氨基酸是影响BphAELB400对DDTs的催化代谢能力的关键氨基酸残基,它可以通过调节反应碳原子与催化中心的距离以及催化腔的大小来影响底物特异性.本次研究进一步阐明了283位氨基酸残基的影响机理,为更有效修复DDTs污染提供理论依据和技术支持.
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作为真核生物中普遍存在的现象,自噬不但实现了对细胞内物质的降解和回收利用,而且与植物病原真菌早期侵染阶段的附着胞发育、膨压升高、菌丝体形成、完成侵染等一系列过程密切相关,并且发挥了重要的作用.本文归纳了植物病原真菌自噬的相关基因和自噬过程;总结了自噬对病原真菌生长发育、致病力的调控和影响;概括了病原真菌自噬所涉及的信号通路;阐明了自噬影响植物病原真菌侵染过程的主要分子机制.为今后以自噬相关基因或蛋白作为靶点来筛选抑制病原真菌侵染的新型药物提供新的策略和思路.
尽管肝细胞癌和肠道微生物群落之间的关系已得到实验和临床证实,但目前这些关系在指导临床诊断和治疗上的应用仍十分罕见.本文就肠道微生物群落与肝细胞癌的关系及其在肝细胞癌诊断中的应用进行综述,并阐述了当前阻碍肠道微生物群落分析用于肝细胞癌诊断的主要因素.此外,我们还讨论了一种新的肠道微生物群落综合指标用于肝细胞癌诊断的可行性和实用性,尽管该指标中使用的细菌类群仍然值得进一步优化.最后,我们对用于该指标计算的细菌类群的筛选提出了建议.“,”Although the relationship between hep
丛枝菌根真菌(AMF)在自然界分布广泛,能与大部分维管植物的根系形成菌根共生体.它们在调节植物群落结构和全球的碳、氮、磷循环等方面发挥着重要的生态功能,也是农林、环境领域最具应用前景的微生物类群.受限于培养方法、研究手段等,长期以来对AMF基因组、转录组特征的认识非常有限.最近10年,AMF基因组和转录组的相关研究在高通量测序技术的推动下取得了较快发展;研究结果也显著提高了对AMF遗传发育、代谢生理、共生机制等的认识.本文综述了目前已完成测序的AMF种类的基因组、转录组信息.结果 发现,已测序的AMF种类
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