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微卫星标记作为1种重要的分子标记，在分子标记辅助育种及遗传图谱构建中都起到重要的作用。EST文库搜索法是获得微卫星标记的途径之一，本研究对坛紫菜EST数据库中6035条序列进行搜索，发现340条EST包含SSR序列，其中三碱基重复最多，占总数45．95％；其次是两碱基重复，占总数的45．38％；再次是六碱基和五碱基，分别占总数的5．78％和2．02％；四碱基最少，仅占总数的0．87％。在两碱基中AG，GA，TC，CT类型数量最多，占所有两碱基SSR的82．8％；在三碱基中CCG，CGC，GCC，GGC，G