【摘 要】
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[目的]对苋菜MDH基因进行克隆及生物信息学分析.[方法]以苋菜试管苗为材料,从实验室构建的苋菜转录组数据库中筛选出苋菜MDH基因的cDNA序列片段,采用RT-PCR技术对其ORF进行克隆,并进行生物信息学分析.[结果]MDH基因编码344个氨基酸,通过生物信息学分析表明,MDH可能为非分泌蛋白,包括33个磷酸化位点,二级结构以α螺旋为主,三级结构是由无规则卷曲结构、α螺旋和β折叠构成的,与藜麦有较近的进化关系,在黑暗条件下和叶片红色部位表达更显著开花期较其他生长时期表达更显著.[结论]为将来深入研究MD
【机 构】
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福建农林大学园艺植物生物工程研究所,福建福州 350002;西北农林科技大学园艺学院,陕西杨凌 712100
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[目的]对苋菜MDH基因进行克隆及生物信息学分析.[方法]以苋菜试管苗为材料,从实验室构建的苋菜转录组数据库中筛选出苋菜MDH基因的cDNA序列片段,采用RT-PCR技术对其ORF进行克隆,并进行生物信息学分析.[结果]MDH基因编码344个氨基酸,通过生物信息学分析表明,MDH可能为非分泌蛋白,包括33个磷酸化位点,二级结构以α螺旋为主,三级结构是由无规则卷曲结构、α螺旋和β折叠构成的,与藜麦有较近的进化关系,在黑暗条件下和叶片红色部位表达更显著开花期较其他生长时期表达更显著.[结论]为将来深入研究MDH基因功能奠定基础.
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