分子动力学模拟研究NCBD与TAD相互作用的构象变化

来源 :德州学院学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：huazhongtan

【摘要】

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P53是固有无序蛋白,在细胞信号转导网络中,起着非常重要的作用,它能引导细胞的降解死亡等.P53和CBP是多位点结合,其中P53的TAD的结构域与CBP的NCBD结构域之间的结合,对P53与D

【作者】

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梁涛马爱静扈国栋王吉华

【机构】

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德州学院山东省功能大分子生物物理重点实验室,德州学院物理与电子信息学院,山东师范大学物理与电子科学学院

【出处】

：

德州学院学报

【发表日期】

：

2016年2期

【关键词】

：

P53蛋白分子动力学模拟构象变化 P53protein molecular dynamic simulations conformational cha

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P53是固有无序蛋白,在细胞信号转导网络中,起着非常重要的作用,它能引导细胞的降解死亡等.P53和CBP是多位点结合,其中P53的TAD的结构域与CBP的NCBD结构域之间的结合,对P53与DNA形成四聚体起到关键的作用.对apo-TAD,apo-NCBD和复合物进行了500ns分子动力学模拟,分析了三个体系的Cα原子的均方根偏差（RMSD）和均方根涨落（RMSF）以及回旋半径（Rg）.分析结果表明复合物比apo-TAD和apo-NCBD单体更稳定,尤其是结合位点附近的残基.

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