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甘蔗是雌雄同株高度杂合的异源多倍体植物.为去除杂交育种过程中因母本去雄不彻底导致的自交现象的干扰,有必要对杂交后代进行杂种真实性鉴定.本研究以'新台糖25号'为母本、'云蔗89-7'为父本进行有性杂交构建大规模遗传群体,获得F1代实生苗共17923株.从54个甘蔗SSR标记中筛选出一个具有父本特异性的SSR标记SMC31CUQ,通过多态性序列分析,重新设计了可特异性检测父本序列的PCR引物对SMC31CUQ-F/SMC31CUQ-1-R,并用其对整个遗传群体实生苗进行PCR鉴定,发现其中有9310株具有该父本特异性SSR标记,占群体的51.94％.大规模真杂种的获得,为进一歩构建甘蔗特定农艺性状亚群体奠定了基础.