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以收集于同一栓皮栎优良单株种子为试验材料，通过脱水和萌发试验确定脱水敏感关键时期，对未脱水（CK）和脱水敏感关键时期种子进行转录组测序分析，探究种子脱水过程中基因表达变化，挖掘与种子脱水敏感性相关的基因。结果表明：栓皮栎种子含水量与萌发率间呈极显著正相关。种子萌发临界含水量在28.20%（T2）左右，致死含水量在17.79%（T11）左右。通过差异基因表达分析，在比较组T2和CK,T11和T2和T11和CK中分别获得4 405、4 066和5 907个差异表达基因。这些差异表达基因分别被富集到生物学过程，分子功能和细胞组分3个功能类别以及内质网中蛋白质加工与植物激素信号传导等代谢通路中。其中，MYB108、MYB1R1、ERF1B、UNE10、CRF4、CML11、JAZ、MYC2、TGA等基因可能调控种子脱水过程中活性氧的产生与清除机制，以及胁迫信号的传导等过程，进而在种子对脱水的响应中发挥重要调控作用。