大鼠肝脏再生终止阶段差异基因表达的生物信息学分析

来源 :检验医学与临床 | 被引量 : 0次 | 上传用户：foonyun_117_126

【摘要】

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目的通过生物信息学方法分析参与肝脏再生(LR)终止阶段调控的相关基因,以探讨该阶段精确调控肝脏大小所涉及的相关分子机制。方法从美国国立生物技术信息中心(NCBI)的高通量

【作者】

：

刘一鸣袁方超王孟皓

【机构】

：

重庆医科大学附属第二医院肝胆外科

【出处】

：

检验医学与临床

【发表日期】

：

2020年7期

【关键词】

：

肝脏再生差异表达基因富集分析蛋白质互作用网络 liver regenerationdifferentially expressed genesenrich

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目的通过生物信息学方法分析参与肝脏再生(LR)终止阶段调控的相关基因,以探讨该阶段精确调控肝脏大小所涉及的相关分子机制。方法从美国国立生物技术信息中心(NCBI)的高通量基因表达数据库(GEO)下载大鼠部分肝脏切除(PH)术后肝组织基因表达数据集(GSE63742),选取LR终止阶段样本(PH术后7 d)并使用R语言筛选出该阶段所有差异表达基因(DEGs)。利用在线功能富集数据库DAVID对DEGs进行富集分析。利用线上蛋白质相互作用检索数据库(STRING数据库)构建DEGs的蛋白质-蛋白质互作用网络(

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