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基于Bayes推断的基因芯片探针特异性估计模型
基于Bayes推断的基因芯片探针特异性估计模型
来源 :计算机工程与应用 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ltxiong
【摘 要】
:
序列相似性计算是生物信息处理中的基本问题。针对基因芯片设计中的特异性评价问题,基于Bayes推断,建立了DNA序列快速估计算法,该算法不需要序列联配(alignment-free),性能好于
【作 者】
:
彭柳
冯圣中
【机 构】
:
中国科学院计算技术研究所国家智能计算机研究开发中心中国科学院计算机系统结构重点实验室,中国科学院研究生院
【出 处】
:
计算机工程与应用
【发表日期】
:
2007年24期
【关键词】
:
探针设计序列相似性估计贝叶斯推断特异性
probe design
sequence similarity estimation
Bayes theory
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序列相似性计算是生物信息处理中的基本问题。针对基因芯片设计中的特异性评价问题,基于Bayes推断,建立了DNA序列快速估计算法,该算法不需要序列联配(alignment-free),性能好于广泛应用的相似性计算工具,可以大幅提高基因芯片设计性能。
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