目的:通过对乌鲁木齐市地区新型农村合作医疗定点医疗机构实施按病种付费前后的住院患者费用数据,进行对比分析,探讨按病种付费模式的实施对患者住院费用产生的影响。方法:通过建立数据库,对住院患者按照ICD-10分类,运用秩和检验和多元方差分析对按病种付费模式实施前后患者住院费用进行统计分析。结果:从住院总费用来看,病种付费有效控制了医疗费用的不合理上涨,其住院费用情况的差异有统计学意义(Z=3.445,P≤0.05);从住院费用结构来看,药品费用是影响住院费用的主要因素,其药品费的差异有统计学意义(F=14.929,P≤0.05)。结论:按病种付费在有效控制医疗费用的不合理上涨、限制过度医疗等方面具有积极意义。药品费用是影响住院费用的主要因素,政府、医疗机构和医疗保险机构应共同努力,采取综合措施,有效控制患者住院费用的过快增长。