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为了给火龙果的突变机制提供新信息，通过 ISSR 标记、DNA 甲基化及检测赤霉素（GA3）含量等方法，对火龙果矮化突变体（D）及其回复突变体（R）进行遗传分析。结果表明：对比野生型（WT），D 和R 均带有不同程度的刺座突变，同时均对 GA3敏感，其中 D 的 GA3含量极显著低于 WT，推测其为 GA3缺陷型的矮化；筛选到3条有多态性差异的 ISSR 引物，D 与 WT 存在有4个位点的差异，R 与 WT 未找到差异位点；D 的甲基化程度比 WT 高2．8％，而 R 的甲基化程度比 WT 低约0．9％。