脂肪干细胞成骨分化的转录因子-miRNA-mRNA网络分析

来源 :中国组织工程研究 | 被引量 : 0次 | 上传用户:y3434jkhgkj
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背景:脂肪干细胞来源广泛、易于获取,人脂肪组织来源的干细胞进入分化骨细胞涉及基因表达的变化主要受miRNA和转录因子调节,但调节脂肪干细胞成骨分化的转录因子-miRNA-mRNA调控网络尚未建立.目的:筛选脂肪干细胞成骨分化过程中的差异表达基因、差异表达miRNA及转录因子,探讨脂肪干细胞成骨分化过程中的转录因子-miRNA-mRNA调控网络及其潜在的靶基因、miRNA和转录因子.方法:从GEO数据库获取3张芯片(GSE37329,GSE63754 mRNA数据芯片2张,GSE72429 miRNA数据芯片1张),筛选差异表达基因和差异表达miRNA;差异表达基因进行PPI网络、GO功能和KEGG信号通路分析;随后差异表达基因预测上游miRNA,差异表达miRNA预测转录因子,通过Cytoscape3.7.1软件构建转录因子-miRNA-mRNA网络图.结果 与结论:筛选出86个差异表达基因(26个上调,60个下调)、16个差异表达miRNA(10个上调,6个下调);PPI网络中蛋白互作共表达的占76.52%,协同定位的占8.69%;GO功能富集分析主要在对经典Wnt信号通路的负调控、软骨发育的负调控等功能相关,KEGG信号通路涉及酪氨酸代谢、脂肪酸降解等信号通路;差异表达基因预测到11381个miRNA及差异miRNA预测到55个转录因子,构建转录因子-miRNA-mRNA调控网络.脂肪干细胞成骨分化过程中的关键基因可能是PODXL、SEMA3D、ADGRG6、LGR4、LPL、CADM3、GRIA1、GPM6B、RERG、APCDD1和NRCAM,重要的miRNA有hsa-miR-502-3p、hsa-miR-762和hsa-miR-1275,核心转录因子是CTCF、TAL1、STAT2、STAT1和TCF3.结果 显示,通过生物信息学技术和数据库挖掘等方法构建的转录因子-miRNA-mRNA调控网络,为脂肪干细胞成骨分化的深入研究提供潜在的治疗靶标.
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背景:随着转基因技术的迅速发展,基因治疗和微囊化技术结合,形成微囊化基因给药技术.微囊化除了为干细胞生长提供良好的三维微环境,保证干细胞的大规模体外培养外,还可利用选择透过性膜将移植物与宿主免疫系统隔离,有效避免同种异体移植过程中的免疫排斥反应.目的:观察微囊化转基因骨髓间充质干细胞与成骨细胞共培养后的增殖活性及成骨分化潜能.方法:采用脉冲式高压静电微囊制备仪制备出APA-Foxc2-BMSCs微囊复合体,行吖啶橙/溴化乙锭双染色;共培养微囊化转基因骨髓间充质干细胞和成骨细胞,共培养3周,MTT检测细胞增
背景:随着医学生物技术的发展,出现了各种人造骨替代物,为未来临床治疗跟骨骨折提供更加广阔的前景.目的:对不同骨修复材料治疗跟骨骨折的方法和进展进行归纳总结.方法:由第一作者运用计算机检索CNKI数据库和PubMed数据库.在标题和摘要中以“跟骨骨折、自体骨、同种异体骨、人工骨”或“Calcaneus fracture,Autologous bone,Allogenic bone,Artificial bone”为检索词进行检索.选择文章与检索关键词材料学特点、生物相容性及其应用效果相关,同一领域文献则选择
背景:异物反应会导致材料植入失败,近些年来对于免疫学的研究逐渐成为热点,选择具有良好免疫性能的支架材料,对于骨缺损修复具有重要意义.目的:探讨去抗原处理的煅烧马鹿角松质骨及未去抗原处理的马鹿角对骨髓来源M1型巨噬细胞生物行为的影响.方法:经过物理及化学方法制备煅烧马鹿角松质骨,通过X射线光电子能谱、傅里叶变换红外光谱检测材料理化性质,制备2种材料浸提液并检测浸提液中Ca、P、Mg的元素水平.体外诱导培养骨髓来源巨噬细胞并在脂多糖和干扰素γ刺激下极化为M1型巨噬细胞,然后与各组浸提液共培养,对照组用单纯IM
背景:选择性瞬变感受器电位蛋白V4(transient receptor potential vanilloid 4,TRPV4)激动剂GSK1016790A能够在短时间内激活TRPV4蛋白,表现为Ca2+内流,而蛋白表达量不变.但是在培养过程中,GSK1016790A会使HeLa细胞膜表面TRPV4表达降低,这一现象对神经再生是否产生影响仍不清楚.目的:探究TRPV4激动剂GSK1016790A在不同时期内对神经元轴突再生的影响.方法:取6-8周龄ICR小鼠背根神经节,经过胶原酶和胰酶处理使细胞充分解离
背景:角膜病移植手术面临着角膜供者严重缺乏、术后发生免疫排异反应等诸多问题.在大力倡导角膜捐献的同时,急需找到一种新的替代性的治疗手段.目的:通过优化骨髓间充质干细胞培养条件,探讨转录因子配对盒基因6对骨髓间充质干细胞向角膜缘干细胞样细胞分化的影响.方法:根据细胞形态、成骨成脂分化能力、细胞表面抗原表达鉴定骨髓间充质干细胞及过表达配对盒基因6的骨髓间充质干细胞.按照培养细胞和培养基不同进行分组:对照组(骨髓间充质干细胞+完全培养基)、实验组A(骨髓间充质干细胞+条件培养基)、实验组B(骨髓间充质干细胞+条
背景:生物支架材料诱导建立的血管网络对于细胞存活和新骨形成是至关重要的.近年来,骨组织工程的学者们更多地关注了骨再生过程中不同支架材料对血管生成的影响.目的:阐述能促进血管生成骨生物支架材料的特点及其在促血管化过程中的作用.方法:由第一作者以“Osteogenesis、Biomaterials、bone defect、Angiogenesis、vascularization”为英文检索词,以“成骨分化、生物材料、骨缺损、血管生成、血管化”为中文检索词,检索PubMed、知网数据库中2016至2020年已发
背景:随着血小板输注的广泛应用,血小板输注无效患者呈逐年增多的趋势.目的:通过对血小板输注无效患者的血小板抗体和交叉配型情况进行检测分析,为血小板输注无效患者提高输注效果提供参考依据.方法:选取2020年4-12月期间112例血小板输注无效患者,使用血小板抗体检测试剂盒(固相凝集法)进行血小板抗体检测及交叉配型实验.结果 与结论:①血小板抗体检测结果:112例患者中有103例血小板抗体检测结果为阳性,阳性率高达92%;②血小板交叉配型结果:有25例患者在交叉配型实验中与供者的血小板均不相合,有18例患者与
背景:颊脂垫常用于修复口腔颌面部缺损,其能使口腔黏膜快速上皮分化.由于缺损创面暴露于唾液中,因而认为唾液可能促进颊脂垫中的脂肪干细胞上皮化.目的:探讨唾液体外诱导促进兔脂肪干细胞上皮分化的可行性.方法:取两三个月龄的新西兰大白兔脂肪组织,分离、培养脂肪干细胞并传代.将第3代脂肪干细胞分为3组,即阴性对照组、表皮生长因子组与唾液组,后两组采用10μg/L表皮生长因子、15%唾液来诱导脂肪干细胞,倒置显微镜观察细胞形态变化,诱导7,14 d采用免疫荧光、RT-PCR检测细胞角蛋白19的表达.结果 与结论:①唾
背景:据文献报道,胸腺上皮细胞数量减少、功能紊乱是胸腺退化的重要因素之一,可导致胸腺发育、增殖缺陷以及外周T细胞功能障碍.课题组前期研究发现间充质干细胞在体内可以逆转衰老胸腺的结构和功能,具体作用机制尚不清楚.目的:探讨脐带间充质干细胞在体外对衰老胸腺上皮细胞的作用及影响.方法:将200μmol/L过氧化氢分别作用于第4代胸腺上皮细胞24,48,72,96 h,通过CCK8法检测细胞活力,筛选200μmol/L过氧化氢作用72 h为制备衰老模型合适时间.取第4代脐带间充质干细胞,与衰老的胸腺上皮细胞共培养
背景:心脏衰老是心脏疾病的主要危险因素之一,而细胞衰老是心脏衰老的主要机制,在衰老相关心脏疾病中起重要作用.作者前期工作发现自噬相关基因Uvrag缺失促进小鼠心脏细胞衰老,Rubicon是Uvrag的抑制性互作蛋白,其对小鼠心脏细胞衰老的作用尚不明确.目的:探讨Rubicon基因对心脏细胞衰老的影响.方法:使用15月龄野生型小鼠、Rubicon基因缺失小鼠、Uvrag基因缺失小鼠作为观察对象,其中Uvrag基因缺失小鼠作为阳性对照.采用荧光定量PCR检测小鼠心脏组织衰老相关分泌表型相关因子mRNA表达变化