论文部分内容阅读
HIV-1整合酶(HIV-1IN)是目前开发抗艾滋病药中最具潜力的药物靶点之-,四聚体是该蛋白发挥生物学功能的主要聚集体形式。为了得到lN四聚体与病毒DNA的复合物,并研究其运动性与生物学功能的关系,采用同源模建、结构优化及叠落等方法,在Tn5转座酶的基础上建立了IN—DNA的复合物模型,并采用高斯网络模型和各向异性网络模型研究四聚体的运动模式。RamachandranPlot分布和Profile-3D结果验证了复合物模型的合理性。运动模式结果表明,四聚体的N-端、C-端的运动有利于螯合DNA,而核心区的