【摘 要】
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目的研究电离辐射对小鼠骨髓细胞中环状RNA(circularRNA,circRNA)的N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenine,m6A)修饰谱的影响,为揭示RNA表观遗传修饰与放射性造血系统损伤之间的关系提供科学依据。方法将24只C57BL/6J小鼠按随机数表法分为健康对照组和照射组,每组12只。照射组用4Gy137Csγ射线对小鼠进行全身照射。照后将两组小鼠脱颈处死,收集股骨中的骨髓细胞。提取总RNA,通过m6ARNA免疫沉淀-高通量测序(MeRIP-Seq)技术和生物信息学分析方法,探究小鼠
【机 构】
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中国医学科学院 北京协和医学院放射医学研究所 天津市放射医学与分子核医学重点实验室,天津 300192中国医学科学院 北京协和医学院放射医学研究所 天津市放射医学与分子核医学重点实验室,天津 3001
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目的研究电离辐射对小鼠骨髓细胞中环状RNA(circular RNA,circRNA)的N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenine,m6A)修饰谱的影响,为揭示RNA表观遗传修饰与放射性造血系统损伤之间的关系提供科学依据。
方法将24只C57BL/6 J小鼠按随机数表法分为健康对照组和照射组,每组12只。照射组用4 Gy 137Cs γ射线对小鼠进行全身照射。照后将两组小鼠脱颈处死,收集股骨中的骨髓细胞。提取总RNA,通过m6A RNA免疫沉淀-高通量测序(MeRIP-Seq)技术和生物信息学分析方法,探究小鼠受照后骨髓细胞中circRNA m6A修饰谱的变化。运用MeRIP-qPCR实验对变化显著的m6A修饰位点进行验证。
结果健康对照组和照射组中各鉴定出325和455个(其中两组共有178个,健康对照组特有147个,照射组特有277个)circRNA的m6A修饰位点。健康对照组和照射组中各鉴定出1 275和1 017个(其中两组共有767个,健康对照组特有508个,照射组特有250个)发生m6A修饰circRNA的来源基因。与健康对照组相比,照射组中有414个m6A位点的富集倍数显著上调,178个m6A位点的富集倍数显著下调,差异具有统计学意义(P
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数据挖掘技术在心血管疾病预后研究中得到较为广泛的应用。其中,在脑卒中预后研究中更多涉及干预有效性的预测,而在其他心血管疾病预后研究中,主要关注自然预后和干预安全性的预测。相较于传统的统计方法,机器学习方法尤其是以神经网络为基础的深度学习技术在预测心血管疾病预后方面有更好的性能表现,值得进一步推广。本文梳理了近些年数据挖掘在心血管疾病预后研究中的应用进展,并对当前研究不足进行总结、提出展望。
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