【摘 要】
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分析云南金花茶转录组中的SSR位点信息及其序列分布特征,为SSR引物的大量开发奠定前期基础。利用MISA软件分析了云南金花茶转录组数据155011条Unigenes的SSR位点信息,在云南
【机 构】
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西南林业大学西南山地森林资源保育与利用教育部重点实验室,西南林业大学云南省高校林木遗传改良与繁育重点实验室,毕节市林业科学研究所,云南省大围山国家级自然保护区河口管理分局
【基金项目】
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云南省林学一级学科建设项目;云南省林业厅国家公园试点建设项目(2136299)
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分析云南金花茶转录组中的SSR位点信息及其序列分布特征,为SSR引物的大量开发奠定前期基础。利用MISA软件分析了云南金花茶转录组数据155011条Unigenes的SSR位点信息,在云南金花茶转录组中共检测到30435个SSR位点,出现频率为19.63%,平均3.46kb就出现1个SSR位点。而重复基元类型从二核苷酸到六核苷酸均有出现,其中二核苷酸重复基元为主要类型,占SSR总数的71.44%;其次是三核苷酸,占SSR总数的25.48%;四核苷酸到六核苷酸仅占3.08%。AG/TC与CT/GA是二核苷酸
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