【摘 要】
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目的 基于DNA甲基化驱动基因开发预测肺鳞癌患者预后的列线图.方法 通过整合癌症基因组图谱(TCGA)肺鳞癌DNA甲基化和基因表达来鉴定甲基化驱动基因,采用Kaplan-Meier生存分析、LASSO回归和多变量Cox回归分析,建立风险评分模型,再对临床参数进行分析,构建列线图,Hosmer-Lemeshow检验绘制校准曲线对肺鳞癌患者生存率进行校准,受试者工作特征曲线(ROC曲线)评估列线图的预测效能.结果 通过MethylMix分析共筛选了45个DNA甲基化驱动基因,基因功能在丝氨酸家族氨基酸代谢过程
【机 构】
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哈尔滨医科大学附属第二医院胸外科,哈尔滨150086
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目的 基于DNA甲基化驱动基因开发预测肺鳞癌患者预后的列线图.方法 通过整合癌症基因组图谱(TCGA)肺鳞癌DNA甲基化和基因表达来鉴定甲基化驱动基因,采用Kaplan-Meier生存分析、LASSO回归和多变量Cox回归分析,建立风险评分模型,再对临床参数进行分析,构建列线图,Hosmer-Lemeshow检验绘制校准曲线对肺鳞癌患者生存率进行校准,受试者工作特征曲线(ROC曲线)评估列线图的预测效能.结果 通过MethylMix分析共筛选了45个DNA甲基化驱动基因,基因功能在丝氨酸家族氨基酸代谢过程、细胞和细胞间黏附连接、细胞和细胞间连接方面显著丰富(P<0.01).经Kaplan-Meier生存分析和LASSO回归分析显示,ATP结合家族亚家族C成员5(ABCC5)、封闭蛋白1重组蛋白(CLDN1)、半胱氨酸蛋白酶蛋白A(CSTA)基因与肺鳞癌患者预后相关(P<0.05).多因素Cox回归分析显示,年龄、TNM分期中N分期和风险评分与肺鳞癌患者的生存时间显著相关(HR=1.73,95％CI 1.09～2.75;HR=2.34,95％CI 1.21～4.52;HR=4.44,95％CI 1.61～12.26)(均P<0.05).构建包含这些变量的列线图,ROC曲线评估显示,该列线图预测肺鳞癌患者3年和5年生存率的准确性较高.结论 DNA甲基化驱动基因(ABCC5、CLDN1和CSTA)的改变与肺鳞癌患者的预后显著相关,构建的列线图模型可用于肺鳞癌患者预后的个体化预测.
其他文献
经皮冠状动脉介入(PCI)是目前治疗冠心病的重要手段之一,而支架内再狭窄(ISR)已成为影响PCI疗效的主要因素.ISR是一个复杂的病理生理过程,其发生是患者自身相关因素、冠状动脉病变特点相关因素、介入相关因素和遗传相关因素等作用引起内皮损伤及功能失调,导致病理性内膜增生,但具体机制尚不明确,且缺乏标准化治疗策略.降低ISR的发生率需要积极预防并控制相关危险因素,也亟待医患双方的共同重视以及分子生物学、科技、药物和介入治疗等领域的进一步发展.
近年来,全球糖尿病患者数量不断增加,糖尿病所致慢性并发症是糖尿病致死的重要因素.大血管病变(如糖尿病心肌病)和微血管并发症(如糖尿病肾病、糖尿病视网膜病变)导致糖尿病患者病死率以及失明和肾衰竭发生率升高,患者整体生活质量降低,严重威胁人类的生命健康.miR-200b在糖尿病并发症中起重要作用,不同类型糖尿病并发症中的miR-200b表达亦不同.miR-200b通过作用于不同靶点影响不同的信号途径,进而影响机体对疾病的调控.未来miR-200b可能成为糖尿病及其并发症诊断和治疗的新靶点.
随着糖尿病患病率的不断升高,糖尿病相关认知功能障碍已成为糖尿病常见且重要的并发症之一,严重影响患者的生活质量.糖尿病相关认知功能障碍的发病机制复杂,主要包括脑血管和血脑屏障损伤、β淀粉样蛋白沉积、tau蛋白过度磷酸化、胰岛素抵抗、神经炎症、脑神经元损伤以及代谢异常等.多种因素共同作用促进糖尿病相关认知功能障碍的发生发展,目前临床尚缺乏有效预防和治疗措施.因此,充分探讨糖尿病认知功能障碍的发病机制,并积极探寻新的作用靶点,有助于降低或延缓糖尿病相关认知功能障碍的发生发展.
由于受体内胰岛素缺乏和胰岛素抵抗作用的影响,糖尿病患者易发生心肌缺血再灌注损伤.在心肌缺血再灌注损伤过程中,物质及能量代谢发挥关键作用.巨噬细胞移动抑制因子(MIF)可通过激活缺氧诱导因子-1α/MIF/AMP活化的蛋白激酶信号通路调节胰岛素的分泌与表达,从而改善糖尿病患者心肌缺血再灌注损伤程度.MIF不仅可优化糖尿病心肌缺血再灌注过程中的能量代谢,其高表达还会在糖尿病心肌缺血再灌注的不同阶段发挥不同作用.因此,明确MIF调节糖尿病心肌缺血再灌注过程中能量代谢的确切机制,可为糖尿病患者心肌缺血再灌注的研究
缺血性脑卒中已成为我国乃至全球人类致残、致死的常见原因之一.认知功能障碍是缺血性脑卒中患者常见的并发症,严重影响患者的生活质量.西医治疗缺血性脑卒中后认知功能障碍效果不佳.根据中医学理论,缺血性脑卒中后认知功能障碍由髓减脑消、血凝痰生、脑络淤塞、脑髓损伤、元神受损、神机失用所致.针灸是中国传统医学的重要组成部分,可通过经络、腧穴的传导作用以及特定的操作手法,改善患者认知功能.因此,未来应进一步深入研究针灸治疗缺血性脑卒中后认知功能障碍的机制,完善针灸治疗的理论依据.
IgA肾病是全球范围内最常见的原发性肾小球疾病,其致病机制尚不完全明确,可能与黏膜免疫关系密切,主要表现在黏膜感染和黏膜免疫功能失调两个方面,目前西医尚无针对IgA肾病的特异性疗法.中医认为,IgA肾病的核心病机为正虚邪实.近年来,临床专家试图从黏膜免疫角度探析IgA肾病中医病因病机,阐述黏膜感染与邪实致病(主要为风邪、湿热)、黏膜免疫功能失调与正虚致病(主要为肺脾肾亏虚)的关联,并以此指导确立治疗法则.从咽论治、从脾胃论治,是经过临床检验的有确切疗效的治疗方法,但未来仍需大量基础和临床研究探索其起效机制
股骨头坏死(ONFH)是骨科常见髋关节疾病之一,致残率较高,发病机制尚不清楚.目前ONFH的主要治疗包括药物和手术治疗,但治疗方式的选择仍存在争议.通过中医辨证个体化防治ONFH成为目前的研究热点.根据不同药理作用、剂型分类、治疗方法采取不同中药防治方法治疗ONFH均取得了一定的临床疗效.因此,明确ONFH中药防治措施的有效性,不仅可为选择可重复性、规范化的ONFH中医药防治方案提供参考,也能为ONFH的治疗提供更多选择.
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