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通过构建科技投入效率评价指标体系,采用DEA评价方法,选取了北京、天津、上海、广州、重庆五大国家中心城市2005年到2009年的数据,运用matlab2010软件进行实证分析,结果表明五大中心城市科技投入产出效率最高的是天津市,上海市的投入产出基本处于较为饱和的状态.最后,针对性地提出了提高中心城市科技竞争力的建议.