【摘 要】
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【目的】通过对陆地棉NF-YA基因家族进行全基因组鉴定,分析其表达特性,鉴定其中与棉花开花相关的基因。【方法】利用生物信息学方法系统分析了其理化性质、基因结构、共线性
【机 构】
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湖南农业大学生物科学技术学院,农业农村部黄淮海棉花遗传改良与栽培生理重点实验室/山东棉花研究中心,山东省滨州市种子管理站
【基金项目】
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国家现代农业产业技术体系棉花体系(CARS-15-05),国家自然科学基金(31671742和31601345),泰山学者计划(No.ts201511070),山东省农科院创新工程(CXGC2016A01)
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【目的】通过对陆地棉NF-YA基因家族进行全基因组鉴定,分析其表达特性,鉴定其中与棉花开花相关的基因。【方法】利用生物信息学方法系统分析了其理化性质、基因结构、共线性、Ka/Ks、顺式作用元件和表达模式,实时荧光定量聚合酶链反应(Polymerase chain reaction,PCR)分析表达特征,采用病毒诱导基因沉默技术验证基因功能。【结果】陆地棉中鉴定到29个NF-YA基因家族成员,分为5个亚组,定位在18条染色体上;全基因组复制和片段复制是GhNF-YA基因家族扩张的主要动力;启动子区含有大量光
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