目的 了解重庆市食源性疾病病原体感染情况，分析可疑饮食及其来源，为食源性疾病防控策略提供参考。方法 收集重庆市27家哨点医院2019～2020年就诊的食源性疾病病例信息。采集就诊病例的粪便或肛拭标本，检测其沙门氏菌、副溶血性弧菌、志贺氏菌、致泻大肠埃希氏菌及诺如病毒情况。结果 共监测4294例腹泻病例，病原体总检出率为12.09%（519/4294），其中诺如病毒5.33%、沙门氏菌4.66%、致泻大肠埃希氏菌1.96%、志贺菌0.12%、副溶血性弧菌0.02%。二、三季度的病原体检出率较高（18.50%，13.00%），呈现较明显的夏秋季高峰。不同年龄组病原体检出率以0～1岁组最高，为19.19%（71/370）。4294例病例中有4289例提供了可疑饮食信息，其中肉与肉制品占19.26%（846/4289）、粮食类及其制品占17.65%（757/4289）；食物加工方式中家庭自制占58.27%（2502/4289），餐饮服务业占30.64%（1314/4289）；食物来源中家庭占55.42%（2377/4289）、餐饮店占12.17%（522/4289）、零售店占10.91%（468/4289）。结论 在监测的病原体中，诺如病毒和沙门氏菌是重庆市食源性疾病的主要病原体，可疑饮食以家庭自制食品占比较大。建议在食源性疾病高发的夏秋季加强食品安全监管，重点关注0～1岁婴儿期人群，开展家庭的食品卫生安全知识宣教。加强食源性疾病主动监测，为开展有效防控提供技术支持。