利用简化基因组测序筛选安格斯牛生长相关的受选择基因

来源 :畜牧兽医学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：myh8888

【摘要】

：

旨在探究安格斯牛生长相关的受选择基因,为肉牛生长相关主效基因的鉴定提供参考。本试验共采集72头南阳牛母牛和14头黑安格斯牛母牛血样并提取基因组DNA。利用SLAF-seq(speci

【作者】

：

吕世杰陈付英金磊张子敬朱肖亭施巧婷辛晓玲楚秋霞

【机构】

：

河南省农业科学院畜牧兽医研究所,河南省畜禽繁育与营养调控重点实验室,泌阳县动物疫病预防控制中心

【出处】

：

畜牧兽医学报

【发表日期】

：

2020年4期

【关键词】

：

南阳牛生长性状候选基因选择性清除遗传分化系数 Nanyang cattlegrowth traitcandidate geneselective swe

【基金项目】

：

国家重点研发计划(2018YFD0501700),河南省肉牛产业技术体系项目(S2013-08),国家肉牛牦牛产业技术体系项目(CARS-37),科研发展专项资金项目(2019CY08),河南省农业科学院科技创新创意项目(2020CX09)

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旨在探究安格斯牛生长相关的受选择基因,为肉牛生长相关主效基因的鉴定提供参考。本试验共采集72头南阳牛母牛和14头黑安格斯牛母牛血样并提取基因组DNA。利用SLAF-seq(specific-locus amplified fragment sequencing)技术获得全基因组SNP标记并对试验个体基因型进行分型。通过计算各SNP位点的遗传分化系数(Fst值)和核苷酸多态性(πratio)筛选两品种间的差异基因组区域,并与动物QTL数据库中牛生长性状QTLs进行比对,重合区域作为候选区域。随后对候选区域内

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