卵形鲳鲹线粒体16S rRNA基因全长序列的克隆与分析

来源 :水生态学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:june_jt
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根据近源物种线粒体序列的同源比对,在16S rRNA基因上、下游保守区域各设计1对通用引物。PCR扩增获得特异的DNA片段,经克隆、测序和比对证实,该片段包含了卵形鲳鲹(Trachinotus ovatus Linnaeus)线粒体16S rRNA全长序列1725bp。对5个个体分别测序比对,发现卵形鲳鲹16S rRNA基因在钦州湾种群个体间存在至少7个变异位点,使5个个体分别具有5种不同的单倍型。将卵形鲳鲹与鲹科其它种的16S rRNA序列进行比对,构建鲳鲹科的系统进化树,支持鲹科下设4个亚科(鲹亚科、鰤亚科、鲳鲹亚科、鰆鲹亚科)的分类系统。研究表明,16S rRNA基因既可用于卵形鲳鲹种群遗传多样性分析,又适用于鲹科鱼类的系统进化分析。
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