文蛤HDAC1基因克隆、时空表达及生长相关SNP位点筛查

来源 :水生生物学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ghmyjp
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为探索HDAC1基因在文蛤生长发育中的作用,研究通过已构建的文蛤转录组文库,利用SMARTRACE技术扩增得到文蛤HD爿C1(Mm.HDAC1)基因的cDNA全长序列,分析了其生物信息学、组织及发育阶段表达特征,并用直接测序法在外显子中筛查生长相关的SNP位点。结果显示,Mm—HDAC1基因的eDNA全长3065bp,开放阅读框1599bp,编码532个氨基酸;氨基酸序列比对发现,文蛤与其他物种同源性为74.3%-78.7%。荧光定量PCR(qRT.PCR)结果表明,Mm-HDAC1基因在文蛤6个组织中均
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