具有胃癌遗传风险的环状RNA筛选及验证

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目的

筛选胃癌遗传风险环状RNA(circRNAs)进行筛选和验证。

方法

选择直系3代亲属患有胃癌的5对胃癌及其配对正常组织,采用circRNAs芯片检测circRNAs表达水平,筛选具有胃癌遗传风险的异常表达的circRNAs。为了验证芯片可靠性,随机选取4个异常表达的circRNAs,在36对胃癌及其配对正常组织采用荧光实时定量聚合酶链反应(RT-qPCR)检测。

结果

将胃癌组织中表达变化1.5倍以上者确定为差异表达者,与正常胃组织比较,其中44个circRNAs表达上调和56个circRNAs下调。随机选择2个下调的circRNAs(circRNA_0004789和circRNA_002373)和2个上调circRNAs(circRNA_0004104和circRNA_0005615),采用RT-qPCR检测36对胃癌及其配对正常组织。结果显示,RT-qPCR检测与芯片检测结果无明显差异,分别为circRNA_0004789:t=1.134,P=0.374;circRNA_0023736:t=2.308,P=0.147;circRNA_0004104:t=0.795,P=0.510;circRNA_0005615:t=3.157,P=0.087。

结论

circRNAs在具有胃癌遗传风险的circRNA存在异常表达,有可能作为胃癌遗传风险关键分子。

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